院长：东北师范大学副校长薛利锋兼任。

执行院长：高宗泽，负责研究院全面工作。

副院长：张泽东，负责教师培养培训工作，分管教师发展中心和深圳市未来教育家培养基地。

副院长：杨卫明，负责对外合作和办公室工作，分管综合办公室和人工智能教育研究中心。

副院长：孟巍，负责科创管理与综合协调工作，分管国家级应用数字创新中心（深圳）和技术转移中心。

（2024年10月更新）